一、施工合同在哪个部门办理备案
(一)《建筑法》第十五条规定：“建筑工程的发包单位与承包单位应当依法订立书面合同，明确双方的权利和义务。”
(二)建设部第89号令，即《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第四十七条规定：“订立书面合同7日内，中标人应当将合同送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。”建设工程施工合同是招标文件的重要组成部分，明确了建设工程发包人和承包人之间的权利义务，是保护建设工程发包人和承包人权益的依据。建设工程施工合同一经生效之后，即具有法律效力，工程发包人和承包人双方就产生了法律上的关系。
(三)《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第二十一条规定：“当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。”
(四)根据《中华人民共和国建筑法》第三十一条规定，(合同备案)发包单位应当在建设工程合同签订的30日内，送工程所在地建设行政主管部门备案。合同发生重大变更的，发包单位应自合同变更后15个工作日内，将变更协议送原备案机关备案。
日常中施工合同备案是由建设单位办理的，但也存在双方一同办理备案的情况。
二、建筑合同怎么备案?
备案的流程包括以下几项：
(一)网上申报
上首先承包人登陆政府门户网站，然后在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，根据合同的具体性质、内容在对应的合同备案表中填写相关信息，打印出带条型码的合同备案表。
(二)办理备案手续
合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。
(三)正式签发合同备案表
备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。
施工合同是包方和承包方为完成商定的建筑安装工程，明确相互之间权力、义务的书面协议。需要在签订合同七日内送工程所在地的县级以上地方人民政府建设行政主管部门备案。合同发生重大变更的，发包单位应自合同变更后15个工作日内，将变更协议送原备案机关备案。